中医药学院创建于 1978年，是北京市属唯一一所培养高级中医药人才的院校，2002年并入首都医科大学，成为其二级学院。

学院共设有中医、中药等6个专业及2个专业方向，它们包括：中医学专业、中药学专业、中药制剂专业、中药经营贸易专业、医学检验专业、视障按摩专业以及中医学针灸推拿方向、中医学美容方向。

学院现有硕士研究生教育、本科生教育、专科生教育及高等职业技术教育、成人高等教育等多种办学层次，学生800余人，教职工156人，其中正副教授、正副主任医师、讲师等专职教师80余人，拥有一支结构合理、实力雄厚的师资队伍，并拥有如杨宝琴、高忠英等一批国家级名老中医。20多年来，已为北京地区培养输送了毕业生2000余人，其中大多数已成为中医药行业的骨干。

近年来，学院广泛开展对外交流，许多国家和地区的学者、专家来学院参观访问，并先后与日本、美国、加拿大、巴西、以色列、台湾、香港等国家和地区的教学、医疗单位建立了友好合作关系，学院也多次派专家、学者出国参观讲学，为弘扬中国中医药文化而不懈努力。

并入首都医科大学后，学院充分发挥中医药教育教学优势，为提高办学层次，创办中西医结合专业做了大量卓有成效的工作。目前，全院师生正以饱满的热情团结一致，锐意进取，为实现首都医科大学的“国内一流，国际知名”的目标而努力奋斗。